利用特色资源，发展专用领域分析仪器及系统。我国在工农业生产、环境保护和食品安全等领域用的科学仪器有一定研发基础。同时，工业企业生产用科学仪器需要提供现场服务，但跨国公司提供现场服务的大多是代理公司，因此，跨国公司难以得到价值链的全部利润，这些给我国仪器生产企业提供了机遇。我国科学仪器产业可重点发展上述领域的专用分析仪器，包括农产品和食品营养成分检测、农药及残留检测、土壤速测等农业和食品专用仪器，环境监测仪、生命科学仪器、煤矿安全检测仪等。
发展有一定研发基础的高档科学仪器产品。“十五”“十一五”期间，国家科技计划支持了一批高档科学仪器的研发，有些项目已经开始产业化。“十三五”期间，建议将这些项目作为产业化支持的重点。依据目前我国的工业基础，还难以制造出具有竞争力的高端质谱仪，但并不是所有使用质谱仪的领域都要求很高的灵敏度和分辨率。在一些特定领域，对于在线、快速、专属性的要求胜过对其他指标的要求，生产这样的专用质谱仪器，不仅可以满足用户的需求，还可以避免与跨国公司直接竞争。
加强通用分析仪器关键技术和关键部件研发，增强产品的可靠性和稳定性。关键技术和关键部件落后，是我国科学仪器设备总体水平落后于发达国家的主要因素。我国在光谱仪器、色谱仪器的关键部件研发方面具有一定基础，尤其是光谱类仪器起步早，国产化程度相对较好，并且有相当一部分仪器出口到海外，但是在可靠性和稳定性方面还需要进一步提高。建议加强这两类通用分析仪器关键技术和关键部件的研发，增强其稳定性和可靠性，并建立仪器应用评价的数据库。
研发高档科学仪器的关键零部件。多数高档科学仪器产品的国内需求量很少，比如大型串级高精度高灵敏度质谱仪、高倍数电子显微镜、高频率核磁等，目前主要依靠进口，可以满足需求。在整机技术攻关时机不成熟的条件下，建议投入经费研制高档科学仪器产品所必需的关键部件，等待时机再研发整机。
加强专用科学仪器应用标准的研发。随着科技不断进步和计算机技术的发展，大量新材料、新技术、新方法涌入分析仪器产品设计应用之中。一些专用仪器和民生仪器也从传统仪器中脱颖而出，如食品检测仪器、石油产品检测仪器等，这些科学仪器的标准均需要明确和完善。
加快发展科学仪器制造服务业，加强应用技术研究。科学仪器制造服务业包括：为用户提供针对市场需求的技术解决方案，提供软件服务，提供科学仪器产品的配套零部件、耗材等。针对这些领域，建议加强应用实验室建设，加快应用技术研究，建立完善的销售服务体系，增强科学仪器产品的附加价值，增强企业的竞争力。
