2018年1月31日，赛默飞与云南省祥云县综合检验检测院签署战略合作协议，双方将携手共建现代化高效检测实验室。
2018年5月2日，赛默飞与西安交通大学签署战略合作协议。双方将就西安交通大学西部科技创新港——智慧学镇（以下简称“创新港”）校级公共平台和专业实验室的建设方面开展深入合作，并共建“西安交通大学——赛默飞创新技术联合实验室”。
2018年6月22日，赛默飞与格诺生物签署战略合作协议，双方承诺将在未来通过强强联合，优势互补，共同开发新一代肿瘤临床检测产品。
2018年10月22日，赛默飞与武汉理工大学签署战略合作协议。此次战略合作双方将以武汉理工大学纳微结构研究中心（NRC）为基础成立联合实验室，进一步提高科学实验室生产力。
2018年9月13日，赛默飞与美康生物达成战略合作，双方承诺将携手并进，共同推动临床质谱仪以及相关配套设备的本地化生产，从而加速临床质谱技术在国内的应用普及。
2018年10月31日，赛默飞与云检医学正式签署战略合作协议。双方将携手共建现代化高效检测实验室，双方还将在检测方法和应用的联合开发、检测人才的培养和发展等方面展开合作。
2018年11月27日，赛默飞与北京和合诊断正式签署战略合作协议，双方将在在实验室运营建设领域的先进技术等方面进行合作。
2018年8月10日，赛默飞与上海桐树生物科技有限公司达成战略合作，双方将在肿瘤体外诊断领域展开深入合作，致力于肿瘤伴随诊断产品的研究和开发，加快肿瘤基因检测服务在中国临床肿瘤市场的落地执行，从而更好地惠及肿瘤患者。
据不完全统计，仅2018年一个年度，赛默飞即与中国本土企事业单位达成了11项战略合作协议。
与此同时，2019年5月，赛默飞与上海锦斯生物技术有限公司签署了战略合作协议。双方将在上海张江科学城（上海国际医学园区）共建基因治疗联合基地，依托赛默飞在细胞和基因治疗领域的产品、技术以及一体化服务的优势，共同推动基因治疗在中国的产业化及商业化发展。
随着赛默飞与中国本土企事业单位相继开展一系列战略合作，赛默飞这一全球仪器行业“航空母舰”型头部企业在中国市场的布局步伐已经呈现日益加速态势。
