食品是人类赖以生存的必须品，自古就有“民以食为天”之说。近年来食品安全事件频发。食品安全包括食品卫生、食品质量、食品营养等相关方面的内容，涵盖了食品（食物）种植、养殖、加工、包装、贮藏、运输、销售、消费等环节。
随着食品资源的不断开发、品种的增加、生产规模的扩大，加工、贮藏、运输等环节的增多，使保障食品安全变得更为艰巨和复杂。因此，有关食品安全的检测技术及应用显得尤为重要，气相色谱技术是十分重要的技检测术之一。
影响食品安全的因素主要来自以下几个方面：（l）微生物、寄生虫等生物污染；（2）环境污染；（3）农用、兽用化学物质的残留；（4）自然界存在的天然毒素；（5）营养素不平衡；（6）食品加工和贮藏过程中产生的毒素；（7）食品添加剂的使用；（8）食品掺伪；（9）新开发的食品资源及新工艺产品；（10）食品包装材料。
气相色谱新型的检测器的产生、以及与其他分析技术如IR、MS的联用，使GC法成为食品质量安全检测的有力工具。例如，近年来毛细管气相色谱法以其分离效率高，分析速度快、样品用量少等特点，在食品农药残留等的GC分析检测上独树一帜。
气相色谱法在食品安全检测领域中的应用主要有以下几个方面：在蔬菜和水果中有机氯、有机磷农药残留和鱼肉类产品中的兽药残留已被社会广泛关注。目前，利用GC/ECD气相色谱检测有机氯农药残留，利用GC/NPD气相色谱检测有机磷和有机氮农药残留，GC/FPD气相色谱检测有机磷和有机硫农药残留等分析技术已经很成熟。
多环芳烃、添加剂及丙烯酰胺含量检测分析
多环芳烃（PAHs）是一类重要的环境和食品污染物，其中很多种具有致突变性和致癌性。食品中的PAHs污染多存在于烟熏和烧烤类食品中，采用GC/MS技术可迅速检测与分析常见的20多种PAHs；利用GC//FID气相色谱检测食品中山梨酸、苯甲酸等食品防腐添加剂含量；使用GC/ECD气相色谱检测油炸食品中的丙烯酰胺含量，使用GC/FID气相色谱测定面粉中过氧化苯甲酰的含量。
发酵饮料产品中风味组分的分析
白酒是我国的传统饮料酒，工艺精良，风味独特，而其香味组成极其复杂。甲醇是白酒中主要有害成分，为了精确测定白酒中酒精含量，检验是否掺假，气相色谱法已成为白酒行业必不可少的检测方法。采用GC/FID气相色谱能检测白酒中甲醇及杂醇油含量。
啤酒、葡萄酒和饮料中有许多挥发性化合物和风味物质，可以通过顶空进样的气相色谱分析（HS-GC）技术监控啤酒中的硫化物等有害组分、有害色素及挥发性气体。
食品包装袋有害物质的检测
食品包装袋中添加了大量增塑剂，其中使用量最大、最普遍的是酞酸酯（邻苯二甲酸酯，PAEs）。酞酸酯在接触到食品中的油脂时，特别是在加热的条件下便会溶解出来，对动物和人体均有慢性毒性，具有致突变、致癌作用。利用GC/FID气相色谱技术可对塑料食品袋及包装食品中的5种酞酸酯，包括邻苯二甲酸二甲酯（DMP）、邻苯二甲酸二乙酯（DEP）、邻苯二甲酸二丁酯（DBP）、邻苯二甲酸二正辛酯（DOP）和邻苯二甲酸二（2-乙基己基）酯（DE-HP）进行准确分离和检测。
