生化分析仪是集光、机、电、算和生物化学分析技术于一体的智能光电医用仪器，大致可以分为四个部分，包括进样系统、光学系统、控制系统和数据处理系统。进样系统是分析的前提，光学系统是整个仪器的核心，控制系统是分析的保证，数据处理系统是功能的扩展。
目前绝大多数生化分析仪都是基于光电比色法的原理进行工作的。其结构可粗略看成是由光电比色计或分光光度计加微机两部分组成。生化分析仪的基本工作原理如图1所示。
图1 自动生化分析仪基本工作原理图
生化分析仪的基本工作原理是由单色光束照射比色皿内的有色液体，通过被测样品对光能量的吸收，由探测器（光电转换器）将光信号转换成相应的电信号，该信号经放大、整流、并转换成数字信号，送入计算机，同时计算机控制驱动电力驱动滤光片轮和样品盘，计算机再根据用户选择的工作方式对测量数据进行处理、运算、分析、保存，打印机同时打印出相应的结果，最后，在测完每组样品之后进行比色皿清洗。
