根据《计算机化系统》附录的要求，除了色谱类(LC和GC)数据，实验室也要确保非色谱类数据的安全性和合规性，比如质谱、红外、核磁等仪器，至少要保证试验时间无法修改。
如今，距公告开始实施已近两个月，虽然因经济原因部分企业可以延期施行，但这已经是大势所趋，未来所有企业都必须符合新版GMP要求才可进行生产。目前进口仪器的相关计算机化系统功能都比较完备，但价格不菲。举例来说，十万分之一的分析天平，其微电脑控制面板可确保操作能够被记录，但价格均在十万元人民币以上，对于药厂来说，一台分析天平显然不可能满足日常生产检验的需求，可想而知，符合新法规的药物分析仪器如果都采用进口仪器，花费必然可观;国产仪器虽然物美价廉，但是在计算机化系统上，却仍为短板，为符合GMP计算机化系统要求，国产仪器厂商将面临严峻挑战。
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