近期,范德堡大学的科研团队提出一种新方法——“适应性 PCR”(adaptive PCR),有望革新传统的 PCR 技术,并为 “手持式 PCR 仪” 带来可能。相关研究成果以 “Adaptive PCR based on Hybridization Sensing of Mirror-Image L-DNA” 为题发表在《Analytical Chemistry》期刊。
PCR 的反应过程包含 3 个基本步骤,依次为:变性(高温环境下模板 DNA 发生变性,由双链变成单链)、退火(低温环境下引物与单链按碱基互补配对的原则结合)、延伸(温度回升至最适宜后,DNA 聚合酶开始合成互补链)。至此获得两条精确复制地 DNA 双链。随后,PCR 反应将进入 “变性—退火—延伸” 的循环,获得更多的半保留复制链,30-40 个循环可以获得几百万倍的基因数量。
由此可见,温度和样本是实现 PCR 的关键因素。基于聚合酶制造的 PCR 仪实际上是一个温控设备,需要控制变性、复性和延伸的温度。室温的变化、样本化学成分的改变都会影响 PCR 反应。所以,实验人员可能需要经过多次试验优化出最佳的样本配比、最高效的温度设置。
尽管技术成熟,PCR 仪器却操作复杂且对样本的化学成分及反应环境高度敏感,这主要是因为没有最直接的方法从分子水平监控反应过程。
为了实现精准控制,范德堡大学的生物医学工程师 Nicholas Adams 和 Frederick Haselton 将 “开箱即用” 的理念应用于 PCR,并提出“适应性 PCR”(adaptive PCR)的新方法。他们利用左旋 DNA(L-DNA)监测、控制 PCR 反应。